Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1qtnf6Q6IR41 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms