Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap20Q6IFT4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms