Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scaf8Q6DID3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scaf8Q6DID3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms