Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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