Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep290Q6A078 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms