Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdk13Q69ZA1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk13Q69ZA1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms