Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Papd5Q68ED3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Papd5Q68ED3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms