Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Sbno1Q689Z5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Sbno1Q689Z5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno1Q689Z5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms