Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp4eQ66X19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp4eQ66X19 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms