Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrc8eQ66JT1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms