Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpd52Q62393 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpd52Q62393 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms