Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ss18Q62280 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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