Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttf1Q62187 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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