Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms