Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prg2Q61878 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg2Q61878 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg2Q61878 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg2Q61878 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms