Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ift88Q61371 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms