Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JrkQ60976 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms