Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc6a4Q60857 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc6a4Q60857 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms