Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms