Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf3Q60803 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf3Q60803 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms