Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf4Q60793 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms