Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdkn2dQ60773 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdkn2dQ60773 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms