Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms