Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MarcoQ60754 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MarcoQ60754 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms