Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csnk2a1Q60737 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a1Q60737 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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