Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SkiQ60698 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SkiQ60698 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SkiQ60698 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms