Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sin3aQ60520 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sin3aQ60520 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms