Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd5Q5VCS6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms