Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brip1Q5SXJ3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms