Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Myh1Q5SX40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Myh1Q5SX40 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms