Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Utp18Q5SSI6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms