Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RilpQ5ND29 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RilpQ5ND29 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms