Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms