Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trim41Q5NCC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trim41Q5NCC3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.7 ms