Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ecm2Q5FW85 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ecm2Q5FW85 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms