Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prkaa1Q5EG47 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkaa1Q5EG47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms