Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrc8bQ5DU41 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms