Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syce1lQ5D525 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syce1lQ5D525 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms