Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Urb1Q571H0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Urb1Q571H0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Urb1Q571H0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms