Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc47Q505F5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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