Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ankrd28Q505D1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ankrd28Q505D1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms