Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp48Q3V0C5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp48Q3V0C5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp48Q3V0C5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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