Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap65Q3V0B4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap65Q3V0B4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms