Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rbm44Q3V089 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm44Q3V089 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm44Q3V089 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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