Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5aQ3UXZ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms