Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms