Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defb48Q3UW22 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms