Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clpsl2Q3UW21 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clpsl2Q3UW21 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clpsl2Q3UW21 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms