Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BB287469Q3UT53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BB287469Q3UT53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms