Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
B230104I21RikQ3USW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230104I21RikQ3USW4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms